Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SURF2Q15527 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms