Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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