Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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