Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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