Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms