Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL19A1Q14993 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL19A1Q14993 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms