Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLINT1Q14677 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLINT1Q14677 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLINT1Q14677 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLINT1Q14677 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLINT1Q14677 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms