Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERV3-1Q14264 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms