Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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