Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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