Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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