Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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