Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms