Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC3Q14003 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms