Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms