Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOFQ13790 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms