Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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