Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR4Q13639 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR4Q13639 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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