Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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