Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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