Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRQ13535 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRQ13535 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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