Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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