Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF1Q13351 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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