Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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