Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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