Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RESTQ13127 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RESTQ13127 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RESTQ13127 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RESTQ13127 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RESTQ13127 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RESTQ13127 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RESTQ13127 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RESTQ13127 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RESTQ13127 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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RESTQ13127 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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