Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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