Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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