Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PRDM2Q13029 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRDM2Q13029 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PRDM2Q13029 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PRDM2Q13029 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PRDM2Q13029 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PRDM2Q13029 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRDM2Q13029 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PRDM2Q13029 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PRDM2Q13029 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRDM2Q13029 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PRDM2Q13029 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PRDM2Q13029 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PRDM2Q13029 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PRDM2Q13029 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PRDM2Q13029 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRDM2Q13029 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC33.76■■■■□ 3
PRDM2Q13029 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC33.76■■■■□ 3
PRDM2Q13029 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
PRDM2Q13029 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
PRDM2Q13029 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PRDM2Q13029 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PRDM2Q13029 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PRDM2Q13029 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
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