Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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