Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms