Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TROQ12816 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TROQ12816 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TROQ12816 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TROQ12816 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TROQ12816 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TROQ12816 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TROQ12816 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TROQ12816 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TROQ12816 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TROQ12816 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TROQ12816 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TROQ12816 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TROQ12816 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
TROQ12816 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TROQ12816 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TROQ12816 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TROQ12816 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TROQ12816 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TROQ12816 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TROQ12816 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TROQ12816 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TROQ12816 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TROQ12816 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TROQ12816 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TROQ12816 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TROQ12816 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TROQ12816 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TROQ12816 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TROQ12816 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TROQ12816 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TROQ12816 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TROQ12816 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TROQ12816 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TROQ12816 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TROQ12816 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TROQ12816 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TROQ12816 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TROQ12816 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TROQ12816 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
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