Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms