Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ABCC8Q09428 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC8Q09428 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ABCC8Q09428 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC8Q09428 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC8Q09428 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC8Q09428 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ABCC8Q09428 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC8Q09428 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC8Q09428 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC8Q09428 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC8Q09428 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC8Q09428 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC8Q09428 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ABCC8Q09428 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC8Q09428 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC8Q09428 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC8Q09428 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ABCC8Q09428 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ABCC8Q09428 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC8Q09428 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC8Q09428 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC8Q09428 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ABCC8Q09428 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ABCC8Q09428 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC8Q09428 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC8Q09428 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC8Q09428 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC8Q09428 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC8Q09428 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC8Q09428 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC8Q09428 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC8Q09428 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC8Q09428 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms