Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms