Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms