Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms