Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms