Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX4Q06945 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms