Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms