Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms