Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms