Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms