Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OCA2Q04671 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms