Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms