Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms