Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms