Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms