Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX6P78412 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX6P78412 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX6P78412 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX6P78412 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX6P78412 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX6P78412 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX6P78412 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX6P78412 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX6P78412 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX6P78412 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX6P78412 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX6P78412 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX6P78412 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX6P78412 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX6P78412 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX6P78412 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX6P78412 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX6P78412 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX6P78412 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX6P78412 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms