Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBBP68871 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HBBP68871 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HBBP68871 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HBBP68871 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HBBP68871 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HBBP68871 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HBBP68871 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HBBP68871 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms